Proteomika sa zameriava na dynamický opis génovej regulácie, kvantitatívne stanovenie hladín bielkovín v génovej expresii, identifikáciu účinkov chorôb a liekov na životné procesy a vysvetlenie mechanizmu regulácie génovej expresie. Ako veda, proteomický výskum nie je z nuly Spočiatku je to rozšírenie proteínového (peptidového) profilu a technológie mapovania génových produktov, ktorá sa používa už viac ako 20 rokov. Mapovanie peptidov sa opiera o dvojrozmerné gélové elektroforézy (2-DE) a ďalšiu analýzu obrazu; a gén Profil produktu závisí od rôznych analýz po separácii, ako je hmotnostná spektrometria, analýza zloženia aminokyselín atď.
Vzhľadom na existenciu variabilnej editácie a úpravy RNA môžu mnohé gény vyjadriť rôzne proteíny. Preto je zložitosť proteómu oveľa vyššia ako zložitosť genómu.
Ak bola celá genómová sekvencia druhu rozlúštená, neznamená to, že proteóm tohto druhu bol tiež dešifrovaný. Špecifická analýza bielkovinového produktu génu by sa mala stanoviť komplexnou úpravou a reguláciou hladiny genómu, úrovne transkripcie a úrovne prekladu.